PCR引物设计,如何进行编辑?

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引物的3“一般要求非常稳定,尤其是最后几个碱基,一定要求保守,因为如果有一个不保守,你就可能扩增出别的片段,一般来说,你对那个物种非常确定(就是序列是已知的),引物3“端以G结尾比较好,如果怕扩不出来,可以以A/T结尾增加扩增出片段的可能性,因为G=C氢键有3个,而A=T只有两个,前者要稳定些。相对而言,5'端不需要那么保守,如果你要考虑上下游引物之间的GC%,Tm比较接近的话,可以在5'端加碱基或者酶切位点。追问我记得3‘端最好是T,最好不要是A,G和C介于中间。

能不能在3’端加碱基从而调整GC%和Tm值。

prime premier 5.0中,正向引物好像不能在5‘端加序列后analyze。

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